Судебное разбирательство по делу Шестакова проходило в феврале и марте 2007 года. Он был оправдан по обвинению в подстрекании к религиозной ненависти, но признан виновным по обвинению в создании «нелегальной» религиозной организации и распространению материалов, содержащих призыв к «религиозному экстремизму». Суд приговорил его к четырем годам заключения в исправительно-трудовом лагере общего режима. В приговоре было выражено недовольство тем, что «более 100 рядовых членов неопытной молодежи, принадлежащих к разным этническим группам, у которых не было независимых религиозных убеждений,» посещали его церковь. В этом же приговоре было сказано, что перевоспитание «невозможно без изоляции от общества». Тюремные власти в Андижане конфисковали его Новый Завет и запретили ему молиться.

В мае 2007 Шестакова перевели в лагерь, который находится в Пскенте, недалеко от Ташкента. Но на следующий день после его прибытия он был помещен в карцер, за якобы «нарушение внутреннего режима лагеря». 25 мая 2007 года суд изменил меру наказания Шестакова на четыре года заключения в исправительно-трудовом лагере строгого режима. В приговоре было сказано, что он не раскаялся в содеянном преступлении. В июле 2007 года Шестакова перевели в лагерь, который находится в городе Навои, лагерь, который известен антисанитарными условиями и применением насилия в отношении заключенных. В этом лагере он снова подвергся давлению с целью отречения от веры, и у него была изъята Библия. В декабре 2007 года узбекские протестанты требовали его освобождения по президентской амнистии, которая была назначена на последующий месяц. По сообщению свидетелей: «Его жена мужественно переносила все трудности, и вместе с тремя дочерьми она ожидала его возвращения домой». «Для нас это тяжело, что его все еще держат в заключении, но наши сердца полны уверенности в том, что Господь даст ему силы и укрепит его». Однако пастора Дмитрия не включили в число лиц, подлежащих амнистии.

Из всех бывших Советских республик, в Узбекистане проводится наиболее жесткая и репрессивная религиозная политика. Любая религиозная деятельность, которая проводится без разрешения властей, считается незаконной и подлежит суровому наказанию в виде штрафа или тюремного заключения. Схожие суровые наказания предусмотрены и по отношению к тем, кто проповедует свою веру. Религиозные собрания, которые проходят по домам, часто подвергаются рейдам полиции и тайной полиции, агенты которой запугивают, бьют, допрашивают верующих и конфискуют любую найденную религиозную литературу. Суды выносят постановления о сожжении конфискованных Библий и другой религиозной литературы. Родителей предостерегают от того, чтобы их дети посещали мечеть или церковь. Телевизионные программы и газетные статьи регулярно клеймят религиозные общины как «опасность» и «угрозу». Более подробную информацию можно найти в «Отчете о религиозной свободе», который находится на «Форуме 18» по ссылке: http://www.portal-credo.ru/site/?act=news&id=54871.